Offre de Post Doctorat en écologie et biotechnologies microbiennes

Contexte de travail et missions

La personne recrutée travaillera à l’UMR FARE (Fractionnement des AgroRessources et Environnement) URCA/INRAE (https://www6.nancy.inra.fr/fare/).

L’UMR FARE développe une partie de ses activités de recherches dans le domaine de la transformation biologique des biomasses végétales et des lignines en mettant en œuvre des microorganismes et des enzymes.

Le/la post-doctorant(e) travaillera sur la mise en place de communauté bactérienne pour la valorisation des lignines. Il ou elle 1) mettra en place les approches permettant le suivi des différentes populations microbiennes par analyses cytométriques et par qPCR ; 2) étudiera la dynamique de production d’enzymes des populations les plus intéressantes par analyses protéomiques et métabolomiques ; 3) mettra en œuvre les enzymes produites en présence de lignines et analysera la transformation des substrats et la libération de molécules d’intérêts.

Activités

• Construction de communauté bactérienne synthétique
• Analyse de population par cytométrie
• Criblage des populations d’intérêts (microfermentation et quantification d’activité enzymatique moyen et haut débit, analyse des substrats par spectroscopie, composition chimique ,…)
• Analyse protéomiques et métabolomiques
• Veille bibliographique dans le domaine d’activité
• Analyse des résultats et communications avec les différents partenaires

Compétences principales

Microbiologie (culturale et moléculaire) et écologie microbienne, fermentations,

Etudes et suivis de populations microbiennes (cytométrie en flux, FISH, qPCR…),

Omiques (protéomiques et métabolomiques), analyses des données méta-omiques (analyses statistiques, utilisation de bases de données…)

Rigueur, Curiosité scientifique, Autonomie 

Communication, Esprit d’équipe

Capacités rédactionnelles et de synthèse

Compétences annexes

Enzymologie et mise en œuvre d’enzymes,

Techniques analytiques (HPLC, spectroscopie fluorescence, FTIR, RMN,…)

Omiques et mise en œuvre (protéomiques et métabolomiques GC-MS, UHPLC-EST-HRMS)

Contraintes et risques

Pas de risque particulier,

Déplacements chez les différents partenaires

Adresse du laboratoire d’accueil : UMR FARE, 2 esplanade Roland Garros, 51100 Reims
Type de contrat : Chercheur en contrat CDD
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 novembre 2025
Niveau de diplôme : Doctorat
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Pour candidater

Les candidat(e)s intéressé(e)s sont invité(e)s à envoyer un CV, une lettre de motivation, ainsi que les coordonnées de deux références académiques à  harivony.rakotoarivonina@univ-reims.fr

Les candidat(e)s préselectionné(e)s seront convié(e)s à une entrevue courant septembre 2025

Date limite de candidature : 1er septembre 2025