Carrière

Depuis 2006-Enseignant-chercheur, en 65è section Université de Reims Champagne Ardenne (UMR FARE)

2004-2006-Chercheur post-doctorante, Université Aix-Marseille III, Faculté des Sciences de Saint-Jérôme (IMRN UMR INRA 1111) : Projet Européen INFABIO QLRT 2002 - 02606.

               -Etude de l’expression de fonctions bactériennes intestinales sous contrôle de paramètres spécifiques de l’écosystème digestif humain et analyse de leur impact sur l’hôte

Formation          

2003-Doctorat en Ecologie Microbienne,  UCB Lyon I / Unité de Microbiologie-INRA Clermont-Fd Theix ; Le système d’adhesion deRuminococcus albus : implication de pili de type IV et de deux glycosyl-hydrolases

1999-2000-Diplôme d’Etudes Approfondies en Ecologie Microbienne, UCB Lyon I

1997-1999-Licence et Maîtrise Biologie Cellulaire et Physiologie, UFR Médecine et Pharmacie Clermont-Ferrand

Domaines de compétences

Microbiologie, biologie moléculaire, ingénierie et biochimie des protéines.

Recherches actuelles

Mon thème de recherche concerne la production des biocatalyseurs efficaces pour le fractionnement biologique des lignocelluloses. Ce thème est abordé par plusieurs questions de recherche :

- L’identification d’enzymes adaptées à divers scenarii de fractionnement de substrats lignocellulosiques à partir d’une bactérie hémicellulolytique modèle.

- La détermination  des facteurs influençant  la physiologie et la dynamique de production des enzymes de dégradation des parois végétales parThermobacillus xylanilyticusenprésence de substrats lignocellulosiques complexes.

- La transformation et l’amélioration de biocatalyseurs enzymatiques par ingénierie protéique afin d’une part d’adapter les enzymes aux substrats ou aux conditions réactionnelles et d’autre part étudier les facteurs intrinsèques liés aux enzymes qui pourraient limiter leur efficacité.

L’ensemble de ces recherches permettrait de mettre au point des cocktails enzymatiques performants ou mimer les processus microbiens afin de mettre au point des prétraitements biologiques efficaces.

Enseignements

Depuis 2007 : 192h de cours (CM-TD-TP) en Microbiologie, Biotechnologies industrielles ; Niveau  Licence et Master, UFR Sciences naturelles et exactes – Université Reims Champagne –Ardenne (URCA)

Encadrement de thèse de doctorat

En cours : PV Revol (co-encadrement) Etude du système hémicellulolytique deThermobacillus xylanilyticuset application de ses enzymes pour le fractionnement des ressources végétales.

Publications principales

Zeder-Lutz G, Renau-Ferrer S, Aguié-Béghin V,Rakotoarivonina H, Chabbert B, Altschuha D, Rémond C (2013). Novel surface-based methodologies for investigating GH11 xylanase–lignin derivative interactions. Analyst, 138, 6889-689.

Aguilera M,Rakotoarivonina H,Brutus A, Giardina T, Simon G and Fons M (2012)Aga1, the first alpha-Galactosidase from the human bacteriaRuminococcus gnavusE1, efficiently transcribed in gut conditions. Research in Microbiology 163, 14-21.

Rakotoarivonina H,Hermant B, Monthé N and Rémond C (2012) The hemicellulolytic enzyme arsenal ofThermobacillus xylanilyticusdepends on the composition of biomass used for growth. Microbial Cell Factories 11.

Rakotoarivonina H, Hermant B, Chabbert B, Touzel J-P and Rémond C (2011) A thermostable feruloyl-esterase from the hemicellulolytic bacteriumThermobacillus xylanilyticusreleases phenolic acids from non-pretreated plant cell walls.Applied Microbiology and Biotechnology 90, 541-552.

Rakotoarivonina H., Terrie C., Chambon C., Forano E., Mosoni P. (2009) Proteomic identification of CBM37-containing cellulases produced by the rumen cellulolytic bacteriumRuminococcus albus20and their putative involvement in bacterial adhesion to cellulose. Archives of Microbiology. 191 (4):379-388.

Rakotoarivonina H.,Larson M. A., Morrison M., Girardeau JP.,  Gaillard-Martinie B., Forano E., Mosoni P., (2005) TheRuminococcus albuspilA1–pilA2 locus: expression and putative role of two adjacentpilgenes in pilus formation and bacterial adhesion to cellulose. Microbiology - SGM 151 : 1291–1299

Rakotoarivonina H.,Jubelin G., Hebraud M., Gaillard-Martinie B., Forano E., Mosoni P., (2002) Adhesion to cellulose of the Gram-positive bacteriumRuminococcus albusinvolves type IV pili. Microbiology-SGM 148: 1871–1880

Autres activités

Membre du comité d’organisation du congrès international « LignoBiotech one », Reims, France, du 28 Mars au 1^er Avril 2010. 1^er symposium sur les Biotechnologies appliquées aux lignocelluloses qui a réuni plus de 200 participants provenant de plus de 20 pays.